Год основания села Большие Санники точно не установлен, но по воспоминаниям старожилов село образовалось в 1927 году.

11 октября 1950 года образовался Санниковский сельский Совет.

В январе 1992 года прекращены полномочия исполкома Санниковского сельского Совета народных депутатов, назначена администрация села.

В декабре 1997 года состоялись выборы депутатов представительного органа местного самоуправления и главы Санниковского сельского муниципального образования.

С 11 февраля 2005 года  изменено наименование органов местного самоуправления: Санниковское сельское поселение, Совет депутатов Санниковского сельского поселения, администрация Санниковского сельского поселения.

В 1936 году образовался Кизинский леспромхоз, село Санники вошло в его состав и получило название лесозаготовительный пункт Санники.

В административное управление Санниковского сельского Совета вошли населенные пункты Кизинского леспромхоза: Верхняя Гавань, Перебоевка, Малые Санники, Военные Санники, Большие Санники, Станочное, Щетниковская речка, Веселый, Безымянный, Тулинское, Дульди, Чильба, Кизи, Еловый.

С 1952 года началось закрытие отдельных населенных пунктов в связи с выработкой лесных массивов.

В 1970 году уцелевшие населенные пункты Дульди, Чильба, Кизи переданы в административное управление Де-Кастринского сельского Совета. Таким образом в составе Санниковского сельского поселения находятся населенные пункты Большие Санники и Тулинское.