Жители Горно-Алтайска удовлетворены качеством воды — оценка в 3,7 балла выше среднероссийского показателя (3,2 балла). При этом почти вся сточная вода (99,6%) проходит очистку. Довольны горожане и качеством воздуха — их оценка составила 4,23 балла против среднего для российских городов уровня в 3,1 балла. Достаточно высоко жители Горно-Алтайска оценили также работу служб по вывозу мусора — 3,7 балла против 3,3 балла в среднем по России. При этом объём вывезенных отходов составляет в Горно-Алтайске 510 кг на жителя в год, что превышает средний для российских городов показатель (437 кг в год).
Горно-Алтайск занимает хорошие позиции и по вовлечению горожан в программы защиты окружающей среды. Около 8% жителей Горно-Алтайска участвуют в экологических проектах (в среднем в городах Индекса доля экоактивистов составляет 6,1%). Более 38% жителей Горно-Алтайска удовлетворены усилиями по сохранению окружающей среды (в городах Индекса таких в среднем 27,3%).
